欢迎关注”生信修炼手册”! limma这个R包可以用于分析芯片数据，也可以分析NGS测序的数据，其核心是通过线性模型去估算不同分组中基因表达量的均值和方差，从而进行差异分析。 limma也是基于raw count的定量方式，但是它并不提供归一化的算法。在官方手册中，推荐采用edgeR的 TMM 归一化算法。完整代码如下 1.  读取文件 读取基因在所有样本中的表达量文件，示例如下 gene_id...

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