LncRNA2Target:lncRNA靶基因数据库

LncRNA2Target:lncRNA靶基因数据库

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lncRNA在基因表达调控中发挥重要作用，研究lncRNA调控的靶基因，有两种研究策略，一种是通过传统的实验手段分析lncRNA结合的蛋白质，从而确定lncRNA与蛋白编码基因的相互作用，常用的手段有以下几种

immunoprecipitation assaysRNA pull down assaysluciferase reported assays

另外一种手段就是通过敲低或者过表达某个lncRNA, 然后检测处理前后差异表达的基因，将差异表达的基因作为该lncRNA的靶基因, 通过芯片或者高通量测序都可以。

LncRNA2Target数据库收集整理了已经发表的lncRNA靶基因数据，最新版本为v2.0, 网址如下

​​两个文件

lncRNA_target_from_low_throughput_experiments.xlsxlncRNA_target_from_high_throughput_experiments.txt

对于高通量数据，还给出了对应的GEO编号，表达谱数据和差异分析的结果，示意如下

通过该数据库，不仅可以查询lncRNA的靶基因信息，还学到了研究lncRNA靶基因的思路。

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