AmiGO2:在线浏览和查询GO信息的利器

AmiGO2:在线浏览和查询GO信息的利器

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GO数据库的信息是非常庞大的，为了有效的检索和浏览GO数据库的信息，官方提供了AmiGO, 可以方便的浏览，查询和-对应信息，官网如下

​​and gene products

在检索时，支持不同的筛选条件，而且可以自定义的-数据。

1. Annotations

该页面提供了物种的GO注释信息，页面如下

2. Ontology

该页面可以对所有Go Tems进行查询和筛选，示意图如下

目前共有44997个Go Tems, 在页面右侧的菜单栏，可以根据Ontology source和SubSet进行筛选。

Ontology source 指的是GO的三大类型，通过​​+​​将对应的条件添加到筛选条件中，目前，BP共有29682个Go Tems;MF共有11120个GO Terms;CC 共有4195个Go Tems。

得到的数据如下

GO:0015009 corrin metabolic process biological_processGO:0015010 tetrahydrocorphin metabolic process biological_process

第一列GO编号，第二列描述信息，第三列分类，通过这种方式可以方便的得到所有Go Terms的信息。

3. Genes and gene products

该页面提供了基因产物和GO之间的对应关系，示意如下

除了以上基本功能外，AmiGO2 还提供了很多实用的小工具，比如​​Visuzlize​​功能，可视化的展示某个Go Terms 在整个GO 数据库中的位置。

会画出输入的Go Terms到根节点的结构，更多的功能请移步官网。

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