miRPath:miRNA相关GO和KEGG功能分析

miRPath:miRNA相关GO和KEGG功能分析

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对于mRNA数据，我们经常通过GO和KEGG富集分析来进行功能分析，对于miRNA数据而言，我们可以通过miRNA对应的mRNA来研究miRNA相关功能。miRpath是一个在线网站，集成了miRNA靶基因数据库, 只需要输入感兴趣的miRNA Id, 就可以从靶基因数据库中获取miRNA对应的靶基因，然后进行GO和KEGG富集分析，网址如下

​​正向检索

正向检索功能用于分析指定miRNA的功能，输入框如下所示

通过​​Species​​​选择对应物种，在​​Add miRNAs​​框中输入感兴趣的miRNA ID，然后选择对应的靶基因数据库即可，kegg pathway运行结果如下所示

2. 反向检索

反向检索功能用于发现调控指定的GO或者pathway下基因的miRNA, 示意如下

我们可以以miRpath作为参考，利用其他数据库或者自己构建的高质量miRNA靶基因数据来进行富集分析，从而研究miRNA相关功能。

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