RNA编辑简介

RNA编辑简介

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RNA editing, 即RNA编辑，指的是转录后的RNA发生的碱基插入，缺失，替换等现象，属于转录后修饰的一种，相比其他转录后修饰，比如可变剪切等，RNA编辑比较罕见，但是其作用和功能不容忽视。

碱基序列的变化，可能会改变密码子的结构，导致产生不同的蛋白质；也可能影响转录本与其他分子的相互作用，从而影响该转录本的调控功能，由于RNA编辑在生命活动中重要的调控功能，在生长发育，疾病发生等过程中，都可能发挥着一定作用，研究这些阶段的RNA编辑现象，是探究生命活动中复杂调控机制的一种新的切入角度。

RNA编辑通常可以划分成以下两类

1. 碱基的缺失和插入

碱基的缺失和插入需要通过一种名为​​guide RNA​​的小分子，示意如如下

上图中，通过​​guide RNA​​的介导完成RNA水平上的插入。

2. 碱基的替换

碱基替换导致密码子改变的示意图如下

在上图中，发生了一个C-U的RNA编辑，导致密码子从​​CAA​​​变成了终止子​​UAA​​, 从而产生了一种新的蛋白。

在碱基替换中，有几种常见的模式，第一种就是上图中所示的C->U的替换，第二种是U->C的替换，第三种最为常见，研究的最为广泛，就是A->I的替换，在物种间具有高度的保守性。

A到I指的是腺嘌呤替换成次黄嘌呤，由腺苷脱氢酶ADAR介导，示意如下

在碱基配对过程中，次黄嘌呤被是被为鸟嘌呤，所以A->I的替换实际上是核苷酸由A变化成G。

RNA编辑现象不仅可以发生了mRNA上，在miRNA, lncRNA等其他类型的ncRNA上也会发生。

高通量测序技术为大规模RNA编辑位点的识别带来了便利，有很多相关的软件，在后续会详细介绍软件的用法。

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