GEPIA:TCGA和GTEx表达谱数据分析平台

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GEPIA整合了来自TCGA和GTEx项目中的基因表达谱数据，提供了多种数据分析和可视化功能，操作简单，方便广大科研人员对肿瘤的表达谱数据进行挖掘，对应的文章发表在Nucleic Acids Research，链接如下

​​General

这部分对基因的功能进行了简单描述，同时给出相关数据库的链接，示意如下

还给出了不同肿瘤中正常样本和肿瘤样本中表达量的对比图，每个点代表一个样本，如下所示

还有柱状图，取了所有样本的平均值，示意如下

无论是哪种可视化方式，都是用于直观的查看肿瘤和正常个体间该基因表达量的差异。

2. Differential Genes

该部分分析在特定肿瘤中正常样本和肿瘤样本中的差异表达基因，可以自己定义差异基因分析的算法和对应的阈值，示意如下

3. Expression DIY

这部分自己选择感兴趣的肿瘤，查看该基因的表达量在多种肿瘤中的分布，提供了dotplot, boxplot, viovlin plot等展现形式，示意如下

如果输入多个基因列表，还可以以热图的形式进行可视化，示意如下

​​T​​​代表tumor, ​​N​​代表normal, 对多种肿瘤中肿瘤患者和正常样本的表达量进行了可视化。

4. Survival

这部分进行生存分析，可以绘制如下所示的生存曲线

还可以分析与生存状态相关的差异基因，结果如下所示

5. Correlation

这部分用于分析两个基因间的相关性，可以自己挑选样本，指定相关系数的算法，结果如下所示

6. PCA

这部分进行PCA分析，指定多组样本，然后根据输入的基因的表达量进行PCA分析，可以生成2D和3D PCA的图，结果如下所示

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